117.info
人生若只如初见

lncrna数据库的数据来源有哪些

lncRNA(长非编码RNA)数据库的数据来源主要包括以下几种:

  1. RNA Central:整合了NCBI GenBank、European Nucleotide Archive (ENA)、DNA Data Bank of Japan (DDBJ)、RefSeq、Rfam、miRBase等多个公共数据库中的RNA序列和注释信息。此外,还包括文献报道中的RNA序列和相关信息,以及来自其他数据库的RNA序列和结构数据。
  2. RiceLncPedia:专门收集整理水稻(Oryza sativa)长链非编码RNA(lncRNA)的数据库,数据来源于NCBI GenBank、RAP-DB、TIGR Rice Genome Annotation Project、MSU Rice Genome Annotation Project Database、Rice Genome Resource Center等。
  3. LncRNADisease:可以查看lncRNA与疾病关系的数据库,数据来源包括文献报道和其他公共数据库。
  4. NONCODE:收集和整合了全球范围内的非编码RNA序列和注释信息,数据来源包括GENCODE、RefSeq、Ensembl和其他公共数据库。
  5. LNCipedia:广泛收集、注释和分类lncRNA的数据库,数据来源于公开可获得的文献和其他公共数据库,如GENCODE和Ensembl。
  6. LncBook:整合了GENCODE、NONCODE、CHESS、LNCipedia、FANTOM-CAT、BIGTranscriptome等10余个数据库的lncRNA数据,提供全面高质量的人类lncRNA集合和参考文件。

这些数据库通过整合不同来源的RNA序列和注释信息,为RNA生物学研究提供了一个全面而准确的资源,促进了RNA研究的发展。

未经允许不得转载 » 本文链接:https://www.117.info/ask/fed63AzsKAwRRAFc.html

推荐文章

  • lncrna数据库的存储结构是怎样的

    lncRNA(长非编码RNA)数据库是一个集成了大量关于长非编码RNA信息的资源库,其存储结构通常包括以下几个关键组成部分:
    lncRNA数据库的存储结构 数据收集与...

  • lncrna数据库的数据可视化方法

    lncRNA(长链非编码RNA)数据库的数据可视化方法主要涉及将复杂的lncRNA数据转化为图形和图表形式,以便于研究人员理解和解释。以下是一些常用的数据可视化方法和...

  • lncrna数据库的使用教程是什么

    lncRNA数据库是存储和管理长链非编码RNA(lncRNA)信息的重要资源,它们为研究人员提供了丰富的数据集和分析工具,以探索lncRNA的功能和作用机制。以下是一些常用...

  • lncrna数据库的数据更新频率

    lncRNA数据库的数据更新频率各有不同,具体取决于不同的数据库及其维护策略。以下是一些具体数据库的数据更新情况:
    LncRNADisease 更新频率:LncRNADiseas...

  • lncrna数据库的使用教程是什么

    lncRNA数据库是存储和管理长链非编码RNA(lncRNA)信息的重要资源,它们为研究人员提供了丰富的数据集和分析工具,以探索lncRNA的功能和作用机制。以下是一些常用...

  • lncrna数据库的数据更新频率

    lncRNA数据库的数据更新频率各有不同,具体取决于不同的数据库及其维护策略。以下是一些具体数据库的数据更新情况:
    LncRNADisease 更新频率:LncRNADiseas...

  • lncrna数据库如何筛选数据

    lncRNA(长非编码RNA)数据库提供了丰富的资源,使得研究人员能够根据不同的研究目标筛选出潜在的lncRNA分子。以下是基于LncBook数据库的筛选教程,以及lncRNA数...

  • lncrna数据库有哪些数据类型

    lncRNA数据库中包含的数据类型多样,主要包括lncRNA的基本信息、序列数据、表达谱数据、功能注释、互作信息等。这些数据类型共同构成了lncRNA数据库的丰富内涵,...