117笔记问答在Ubuntu上安装GROMACS的步骤如下：
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打开终端（Terminal）。
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更新软件包列表，输入以下命令：
sudo apt update
- 安装GROMACS所需的依赖项，输入以下命令：
sudo apt install cmake build-essential libfftw3-dev libhwloc-dev cmake-data libopenmpi-dev libboost-all-dev
- 下载GROMACS源代码，可以从官方网站下载最新版本：http://www.gromacs.org/Downloads
也可以使用
wget命令直接下载，例如下载版本2021.5：
wget http://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/gromacs-2021.5.tar.gz
- 解压下载的源代码文件：
tar -zxvf gromacs-2021.5.tar.gz
- 进入解压后的目录：
cd gromacs-2021.5
- 创建一个构建目录并进入：
mkdir build cd build
- 运行cmake来配置编译选项：
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
这里，我们启用了自带的FFTW库，并下载回归测试所需的数据。你可以根据需要调整其他选项。
- 编译GROMACS：
make
- 安装GROMACS：
sudo make install
- 为了在终端中方便地运行GROMACS，你可以将其添加到系统路径中：
echo "export PATH=\$PATH:/usr/local/gromacs/bin" >> ~/.bashrc source ~/.bashrc
现在你已经成功地在Ubuntu上安装了GROMACS，可以通过在终端中输入gmx来运行它。